Pueden agujerarse de un disparo una moneda en el espacio exterior, donde las balas no pesan?

No pesan, porque no hay gravedad, pero siguen teniendo su masa, por lo que cuando la disparas la bala sale del arma con una aceleración que la dota de una fuerza (F = m * a), cuando cocha contra la moneda ejerce una presión sobre ella (P = F / s) que será mayor cuanto menos diámetro tenga la punta de la bala.

Si la presión es lo suficientemente grande como para vencer la fuerza de unión de las moléculas de la moneda (su fuerza de resistencia), la moneda obviamente será atravesada por la bala, en caso contrario no, pero vamos que pasaría exactamente lo mismo que en la tierra con gravedad (como has visto esta no aparece en ninguna de las ecuaciones implicadas en los cálculos).