Se considera que se inició el16 de noviembrede1532cuando unejército incaicose reunió enCajamarcacon losconquistadores españolesencabezados porFrancisco Pizarro, a poco de haber finalizado laguerra civilentre los dos herederos al trono incaico, HuáscaryAtahualpa(hijos del incaHuayna Cápac).
En dicho encuentro, Atahualpa, que aún celebraba su triunfo sobre Huáscar, fuetomado preso por los españolesy meses después ejecutado, el26 de juliode1533.
Posteriormente los españoles, aliados con los cañaris, chachapoyas y otras etnias hasta entonces vasallas de los incas, marcharon aCuzco, la capital del imperio, donde ingresaron el14 de noviembrede 1533 y proclamaron como nuevo inca aManco Inca, con la intención de convertirlo en un rey títere.
Pero pronto Manco encabezó una guerra de reconquista, sitiando el Cusco y la recién fundada ciudad deLima(1535).
Aunque causaron grandes bajas a los españoles, Manco tuvo finalmente que retirarse a las agrestes montañas de Vilcabamba, donde instaló la sede de la monarquía incaica (1538), mientras que el resto del territorio era ocupado por los españoles, que llevaron adelante el proceso de asentamiento y colonización.
El reinado de estosincas de Vilcabambaduraría hasta1572, cuando elvirreyFrancisco de Toledoejecutaría al último de ellos : Túpac Amaru I.
La conquista del Imperio incaico duró pues, en propiedad, cuarenta años (1532 - 1572).