Los cromosomas homólogos, son un par de cromosomas que, durante la reproducción sexual se recombinan durante la meiosis.
Tienen los mismos loci y la misma estructura, pero, en vista a que cada uno proviene de un progenitor diferente (uno del padre y uno de la madre) poseen distintos alelos.
Un alelo o aleloide, es cada una de las diferentes formas que puede tener un mismo gen.
La persona hereda dos alelos para cada gen : uno de la madre y otro del padre.
Dentro de los cromosomas homólogos, los alelos se organizan en la misma posición, pero pueden contener la misma o diferente información sobre un determinado carácter.
Por ejemplo, los dos cromosomas homólogos contienen información sobre la coloración de los ojos, pero, el alelo que transporta uno proporciona el color marrón y el otro el color verde.
Por otra parte, los cromosomas heterólogos, o no homólogos, no poseen características en común, y tampoco se unen durante la reproducción sexual.
En el caso de los humanos, estos corresponden al par 23, es decir, los cromosomas XY.