En que se diferencia el reino eubacteria y el reino archaea?

No son reinos, sino Dominios, taxón incluido por Carl Woese en 1979, al hacer estudios a nivel de ARN ribosomal en los seres vivos.

Se diferencían en que en el Eubacteria encontramos a todas las bacterias gram positivas y gram negativas que existen en la tierra cuya membrana difiere de las archaea en que éstas se encuentran únicamente en lugares con mucha sal, donde existe gas metano y donde la temperatura es muy caliente, con membranas como con estructuras muy simples.