¿en que casos no se cumple la tercera ley de mendel?

Si los caracteres que Mendel estudio hubieran estado ligados, es decir en una posición muy cercana del mismo cromosoma, ambos caracteres no segregarían independientemente, es decir por ejemplo si tengo un genotipo AaBb, con AB en un cromosoma y ab en el otro cromosoma homologo, si estuvieran ligados los únicos gametos posibles que pueden aparecer serían AB o ab, mientras que si no estuvieran ligados o bien estuvieran en cromosomas diferentes (que para el caso resulta lo mismo) los posibles gametos serían AB, Ab, aB o ab.

Lo interesante es que Mendel sí encontró caracteres ligados, pero no pudo explicar por qué esos caracteres se comportaban de dicha forma, entonces hizo lo que cualquier científico haría, simplemente descartó los resultados que no supo explicar y analizó los que pudo razonar, de todos modos el aporte que hizo Mendel fue muy importante para el desarrollo de los conocimientos sobre la genética.