¿Cómo se habrían originado los orgánulos citoplasmáticos de las células eucariotassegún la teoría autógena?

Una de las principales evidencias que apoyan esta teoría es la existencia de bacterias que contienen estructuras intracelulares rodeadas por membranas que pueden considerarse primitivos orgánulos.

Ejemplos son los tilacoides de las cianobacterias, los compartimentos que contienen amonio monooxigenasa en Nitrosomonadaceae y diversas estructuras en Planctomycetes, incluyendo una membrana que rodea su nucleoide.

Sin embargo, los mesosomas, que antiguamente se pensaba que eran invaginaciones de la membrana plasmática, actualmente se consideran artefactos como consecuencia de las técnicas de fijación utilizadas en la preparación de muestras en microscopía electrónica.